This case is about whether a Muslim must perform ablution before every prayer. The consesus is that ablution is only necessary after going to the bathroom. However, that is known from the Sunna, not from the Quran. Here is the verse,
This is Ibn Al-Jawzi's discussion. He refutes the case because he rejects that the Sunna can abrogate the Quran,
ذكر الآية الثالثة: قوله تعالى "إذا قمتم إلى الصلاة فاغسلوا وجوهكم". اختلف العلماء فيها على قولين:
الأول أن في الكلام إضمارا تقديره إذا قمتم إلى الصلاة محدثين، وهذا قول سعد بن أبي وقاص وأبي موسى وابن عباس والفقهاء.
والثاني أنه على إطلاقه وأنه يوجب على كل من أراد الصلاة أن يتوضأ سواء كان محدثا أو غير محدث، وهذا مروي عن جماعة منهم علي وعكرمة وابن سيرين. ثم اختلفوا هل هذا الحكم باق أم نسخ، فذهب أكثرهم إلى أنه باق وقال بعضم بل هو منسوخ بالنسبة، وهو حديث بريدة أن النبي صلى الله عليه وسلم صلى يوم الفتح بوضوء واحد فقال له عمر صنعت شيئا لم تكن تصنعه فقال عمدا فعلته يا عمر. وهذا قول بعيد لما سبق بيانه من أن أخبار الآحاد لا تجوز أن تنسخ القرآن، وإنما يحمل فعل رسول الله صلى الله عليه وسلم هذا على تبين معنى الآية وأن المراد إذا قمتم وأنتم محدثون، وإنما كان يتوضأ لكل صلاة لطلب الفضيلة. وقد حكى أبو جعفر النحاس عن الشافعي أنه قال لو وكلنا إلى الآية لكان على كل قائم إلى الصلاة الطهارة، فلما صلى رسول الله صلى الله عليه وسلم الصلوات بطهور واحد بينها فيكون المعنى إذا قمتم وقد أحدثتم فاغسلوا. وقد قال بعضهم يجوز أن يكون ذلك قد نسخ بوحي لم تستقر تلاوته فإنه قد روى أبو جعفر ابن جرير الطبري بإسناد عن عبد الله بن حنظلة الغسيل رضي الله عنهما أن النبي صلى الله عليه وسلم أمر بالوضوء عند كل صلاة فشق ذلك عليه فرفع عند الوضوء إلا من حدث
I concur with Ibn Al-Jawzi and the majority opinion that the Sunna cannot abrogate the Quran. We discussed this point in
this topic. I also agree with Ibn Al-Jawzi that 5:6 means when someone has been to the bathroom. This is made abundantly clear by the subsequent sentences which specify what to do when one has ejaculated and what one should do when no water is around. There is no need to think abrogation here.
Lastly, Ibn Al-Jawzi mentions a narration reported by At-Tabari and narrated by Abdullah ibn Hanzhala that the Prophet (PBUH) first ordered ablution before every prayer then changed that later to be only after one has been to the bathroom. No authentication of this was made however. And even if it were authentic, it would be a case of Sunna abrogating Sunna and thus has no bearing on the issue of abrogation in the Quran.